最近，Sahashi采用免疫过氧化物酶的方法展示出现C9在突触后接合褶和突触间隙，类似C3补体的分布区。激活C9补体致不可逆的膜破坏，这支持补体介导的溶解在重症肌无力膜破坏机制中的作用，这不同于其他情况，例如Ducenn脊髓病性肌萎缩，它的接合褶被破坏，并没有IgG或Cq补体参加。最近资料指出，胸腺可能激活补体的替代途径并加速此反应的过程，抗体也可能使受体引起补全倡导的溶解。体液免疫机制很重要，但在重症肌无力发病机制中仍不能排除细胞介导的免疫机制。实验性研究展示，在后期发作的病人，其周围循环血中的T细胞减少，主要减少T细胞的亚类3AI和OKT4。切除胸腺后。这些变化恢复正常。

重症肌无力免疫学的病因尚无定论，自身免疫性疾病多发生在遗传的基础上，遗传柯能为其内因；在外因中，多数人认为与胸腺的慢性病毒感染有关。具有HLA-A1、A8、B8、B12、Dw3、的重症肌无力病人多为女性、青年起病，胸腺增生、无肿瘤、乙酰胆碱受体抗体检出率低，用抗胆碱酯酶药无效，早期切除胸腺疗效好。具有HLA-A2、A3的症肌无力病人多为男性，40岁以后起病，多合并胸腺瘤，乙酰胆碱受体抗体检出率高。上述提示遗传因素有重要作用。　　胸腺因素：本世纪初书籍胸腺与重症肌无力无关，近50年，胸腺切除的资料说明胸腺因素在发病机制中起重要作用。

胸腺的慢性、持续性病毒感染（胸膜炎），使其上皮细胞变成具有新抗原性的肌样细胞，它们与胚胎肌样细胞，它们与胚胎肌细胞很相似，是成熟淋巴细胞的前辈，胸腺B淋巴细胞增多，使B淋巴细胞出现异常，导致产生大量自身抗体。这些肌样细胞具有的乙酰胆碱受体，其抗原性与横纹肌细胞的乙酰胆碱受体有交叉，即由胸腺肌样细胞新抗原所产生的大量抗体，也抗横纹肌细胞神经肌肉接头处的乙酰胆碱受体，于是引起自身免疫性疾病——重症肌无力。已患胸腺炎的胸腺，也可能产生一群T杀伤细胞，破坏神经肌肉接头处，或生殖出一群T辅助细胞，刺激周围循环血中的淋巴细胞产生乙酰胆碱受体抗体。

胸腺切除后症状缓解的原因，可能除掉了下列来源： ①乙酰胆碱抗原； ②乙酰胆碱受体抗体的产生； ③直接攻击神经肌肉接头处已致敏的T杀伤细胞； ④促使周围淋巴细胞生产抗体已致敏的T辅助细胞； ⑤激活补体途径导致补体介导溶解的胸腺因素。也有不些重症肌无力病例胸腺切除无效，可能由于： ①切除不完全； ②神经肌肉接头处的损伤已不可逆； ③在胸腺处，位于脾脏和周围淋巴结中的淋巴细胞群仍引起类胸腺的影响； ④长期存活周围的T细胞仍有活性；⑤异原疾病机制，每位病人对胸腺影响的反应不同。